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重重庆大学生物工程研究院拥有国家生物力学重点学科、国家教委生物力学及生物流变学开放实验室、国家２１１重点资助学科和博士后流动站。由于在生物流变学、细胞力学与组织生长和重建、生物可降解材料、组织工程技术、生物医学信息检测技术及系统、药物流变学等学科领域中取得了独具特色的成果，在国内外享有一定的声誉。研究院有国内一流配套较齐全的实验基地；第一批获准授权的硕士点及博士点。在读研究生２２人，已授位硕士３３人、博士２１人；现有教职员工２３人，其中正、副教授共１１人。“七五”和“八五”期间，先后承担国家、省、市及横向科研课题六十余项，获国家自然科学三等奖、国家发明三等奖及四等奖各１项，部委省级奖十多项，以我院吴云鹏教授（前重庆大学校长）为首牵头全国八个重要科研机构承担完成了关于血液与肝胆流变学的国家自然科学基金重大项目，研究质量被评为Ａ级，其中一些成果已列入国家科委的“火炬计划”，正在推广。“九五”期间，研究重点纵深入细胞工程、组织工程、分子生物学领域，并向生物工程相关领域如食品发酵、制药等方面逐渐拓宽。

以我院教师林建国副教授从1994初大胆地提出这样一种观点：世界医药学的发展远远跟不上医学的发展。人类为何不在生物学、生物化学、医药学的交叉点找到一把金钥匙，打开人体内中西药无法打开的大门呢？基于这一认识，他勇敢的承担起了这项被称为跨世纪生物工程的课题研究。经过一年多的不懈努力，一种以活性肽为主的功能型口服液——生物导弹富豪生物键口服液诞生了。吴云鹏教授及国家科委研究员陈锦琛等老前辈成为该产品的第一批试用者。后又根据全国上万例试用情况，经有关权威专家鉴定后认定，这种超越微生态的新型口服液的确不同凡响，所含活性肽可靶向、定点，迅速达到人体病灶，解决多种中西药难以解决的疑难杂症。接下来林建国副教授又开始致力于研究细胞活性肽对人体肌肤细胞代谢的作用，研制出一种新型护肤美容用品——细胞活性肽原液护肤美容液，能快速有效地消除各种因细胞代谢低沉、内脏功能障碍导致的面部皱纹、黄褐斑、雀斑、老年斑、暗疮、粉刺、青春痘等症状。许多从前在美容院反复试用其它护肤用品都未能达到满意效果的顾客，在使用了该产品后，纷纷露出了开心的笑容，并在评价该产品的时候竖起了大拇指。

以以上两项成果从问世以来就美誉四起，获奖不断，先后获得过95国家级科技成果重点推广计划及国家教委科技进步一等奖、四川省青年科技奖、98澳门首届亚洲尤里卡世界发明博览会国际金奖等，林建国副教授也因此被英国剑桥大学IBC、美国传记中心ABI、中国国际名人研究院收录，其先进事迹先后被中央人民广播电台、新华社、南方日报、四川日报、重庆日报、重庆晚报、重庆经济报、广西日报、重庆电视台等新闻单位报道。在99深圳首届中国国际高新技术成果交易会上，上述两种产品深受广大参观者的青睐，整个交易会期间，众人争购该产品的的场面，被誉为高交会上最为“火爆”的景观之一。